如果想要根治巧克力囊肿，就需要进行根治性手术。这项手术大多适用于没有生育要求，症状比较严重的女性，手术的方式包括有经腹腔镜手术和开腹手术，需根据自身的状况和适应症来选择合适的手术方式。有些在做完手术之后，仍然需要结合药物来辅助治疗，有利于加快症状的恢复。如果巧克力囊肿症状相对较轻，并且有生育的要求，就需要保留卵巢功能，同时辅助药物来治疗。如果女性平常身体有性交疼痛或者严重痛经等症状，就应该高度警惕，可能和巧克力囊肿有关。
