胃酸反流性食管炎在医生指导下服用制酸剂、胃肠道动力药以及胃黏膜修复剂等药物进行对因对症治疗比较好。
胃酸分泌过多是引发胃酸反流性食管炎的主要病因，所以需要积极按医嘱服用各种制酸剂来抑制胃酸的分泌。常用的制酸剂有奥美拉唑、雷贝拉唑、泮托拉唑等质子泵抑制剂，另外也可以服用雷尼替丁、法莫替丁等H2受体拮抗剂。
胃动力不足可导致胃内酸性内容物上逆引发胃酸反流性食管炎，所以治疗方面还需要配合多潘立酮片、莫沙必利片、西沙必利片等胃肠道动力药物来一起治疗。这些药物的使用可有效缓解患者反酸、胃胀、恶心、呕吐等临床表现。建议患者在医生指导下用药。
胃酸反流性食管炎发病期间，胃酸的侵蚀可导致食管黏膜不同程度受损。对于食管黏膜受损较为明显的患者而言，医生会建议同时服用胶体果胶铋胶囊、康复新液等胃黏膜修复剂来修复损伤的食管黏膜。
