长期便秘通过一般治疗、药物治疗和清洁灌肠的方法进行治疗最有效。
针对于便秘相对较为轻微的，可以通过多饮水，多吃些富含膳食纤维的食物进行缓解。纤维素不仅能够使粪便的容积增加，而且还能够促进肠胃蠕动，促使粪便排出。
一般治疗效果较差的患者，可以根据自身的具体情况选择酚酞、番泻叶、乳酸菌片、硫酸镁等调节肠道菌群、促动力药和泻药进行治疗。
针对药物治疗仍效果较差的患者，则可以通过在肛门内使用开塞露或肥皂水进行灌肠的方式，对肠道内部进行润滑，促使粪便排出。
