做肛瘘手术后多长时间能恢复与患者的具体病情、恢复情况有关，不能一概而论。
手术后出现的疼痛不适症状约7~14天左右。具体的伤口愈合时间，与肛瘘高、低位，瘘道范围、组织纤维化及肠道功能等关系密切。低位单纯瘘缝合术患者的伤口愈合时间为7~14天左右，低位肛瘘开放性术后患者的伤口愈合时间一般需要20~30天；高位复杂性肛瘘患者的伤口愈合时间一般需要45~60天。
如果在伤口恢复期间，因对某些药物、食物过敏，出现湿疹等症状，或有反复多次手术史，局部组织纤维化严重等原因，愈合则会延迟，甚至需3~6月。
