一般在临床上艾灸顺序有一定的要求，应遵循先灸上后灸下，先灸背部后灸腹部，先少后多的原则。
人体有阴阳之分，身体上部属阳身体下部属阴，艾灸温补阳气，阳气由上而下，使浊阴往下降，故一般先灸上后灸下。而背部在人体属阳，腹部属阴，背部有较多经络，如膀胱经，是人体排毒通道，先灸背部阳气盛，气血才好运行，调节阴阳，加速排出毒素，故先灸背部后灸腹部。
艾灸还应遵循先少后多，循序渐进原则，若动辄大量艾灸，不仅不能起到固本培元作用，很可能会虚不受补，引发其他病症。
如果艾灸顺序不正确，不仅影响效果还会打乱人体气息，适得其反，还可能会出现咽干、头晕、恶心等症状。
