肛瘘病人可采取保守方法进行治疗，但只适用于择期手术的人群，主要目的是为了减轻症状和减少发作次数，但是达不到治愈效果。肛瘘临床以手术治疗为主，手术治疗能在保护肛门功能的前提下，还能治愈肛瘘。
手术方法比较多，需要根据病情来选择，一般可采取无痛、微创、整形手术等，比如瘘管切开术、肛瘘切除术、切开挂线术等。
日常生活中还要调理便秘，清洁肛门，避免饮酒、禁食辛辣刺激性的食品，也要避免做剧烈运动。此外，对于糖尿病病人需要严格控制血糖。
