临床上，最常用的肝癌分期方法是国外的BCLC分期和中国肝癌分期，根据肿瘤大小、数量、有无血管侵犯、肝外转移、肝功能和全身情况，可将肝癌分为I-IV期，或者早、中、晚期和终末期。
肝癌的诊断需要结合既往病史、影像学和实验室检查结果等，必要时，还要进行肝脏穿刺活检。肝癌患者多有慢性肝病背景，最常见的是病毒性肝炎感染，在我国肝癌患者中90%都有乙肝病毒感染。影像学检查包括B超、增强CT、增强核磁等，实验室检查包括甲胎蛋白、甲胎蛋白异质体、异常凝血酶原等，对于难以确诊的病灶，可通过肝脏穿刺活检来确定病灶的具体性质。
