十二指肠息肉要根据病变的性质来判断是否需要切除。比如腺瘤性息肉、神经内分泌肿瘤、产生症状的息肉需要切除，其他的炎症性息肉、增生性息肉则不需要切除。
小肠的腺瘤最好发于十二指肠，分为管状腺瘤、绒毛状腺瘤、混合性腺瘤，有一定的癌变率，需要切除。
神经内分泌肿瘤也有潜在恶性的可能性，也需要内镜下或外科手术切除，而少见的错构瘤性息肉也有一定的癌变率，这部分患者中有些患者口唇有黑斑，容易识别。
另外部分产生症状的息肉，比如肠梗阻、消化道出血的患者也需要切除。
一般情况下，炎症性息肉、增生性息肉则不需要切除。
