内分泌性高血压会导致高血压的急慢性并发症，同时由于内分泌激素的异常增高会导致一系列的内分泌紊乱和相应的并发症。
内分泌性高血压的特点常常是血压非常高，一般的降压药物很难控制，属于难治性高血压，所以高血压的并发症也比一般的高血压多，容易发生脑出血、脑卒中、诱发心肌梗塞、心绞痛和心力衰竭的发生，高血压肾病和眼底病变发生的几率也明显增加。
另外内分泌高血压除了血压高，还同时合并其他的代谢异常进一步导致机体损伤。如原发性醛固酮增多症常常高血压合并低血钾，低血钾可以导致四肢无力、心律失常的发生。如皮质醇增多症还可以合并糖尿病，加重心脑血管损伤。
