少部分免疫性甲减时间久了有可能会变成癌，但大多数情况下都不会癌变。
甲减并不是甲状腺癌的危险因素，但是甲状腺癌的危险因素中有一项自身免疫所导致的甲状腺癌，是由于甲状腺组织受到持续的免疫损伤而发生癌变，但是这种情况比较少，通常还是与甲亢相关。
甲状腺癌的病因其实并不是非常明确，考虑与电离辐射、饮食中碘摄取过高或过低，以及促甲状腺激素等相关，另外甲状腺癌也具有一定的遗传倾向，但是机制不明确，同时女性患者的甲状腺癌发病率较高，考虑与雌激素相关。
因此，综上所述，只有很少部分的甲减患者可能会出现癌变，大部分都不会。
