肛瘘主要是肛周脓肿自行破溃，在切开排脓后伤口经久不愈，形成肛瘘外口，症状可表现为外口反复流出少量脓液，经常会污染内裤，脓液刺激到肛门周围皮肤，可引发肛周湿疹或皮肤瘙痒。
如果肛瘘外口暂时封闭，造成积液积聚，局部会形成脓肿，并伴随肿痛、红肿，脓肿破溃后会形成新的外口，如果反复发作，可形成多个外口。部分较大的高位肛瘘，不受肛门括约肌的控制，可能会有粪便或气体排出。
肛瘘一旦形成，一般不会自愈，需要通过手术进行治疗，手术原则是将瘘管切开或切除，促进伤口的愈合。
