一般情况下，肛管炎患者以保守治疗措施为主，如果形成局部脓肿或发生肛门狭窄等情况，可以考虑手术治疗。
肛管炎的发生，考虑和患者生活饮食习惯、肛肠科病变（痔疮、肛裂、肛窦炎、肛乳头肥大等）、肠道病变（溃疡性结肠炎、克罗恩病、肠癌等），以及自身免疫系统异常等因素相关。发病以后，患者临床症状以肛管区域瘙痒、疼痛为主，部分患者可能有出血的症状。
在患者就医确诊病情后，一般情况下，以保守治疗措施为主。一方面，在肛管区域用药，促进症状的消退，例如肛入痔疮栓、肛入痔疮膏等。另一方面，要祛除致病因素，减轻对肛管区域的刺激，从而稳定病情。
如果患者病情特别严重，特别是形成局部小脓肿或由于长期炎症刺激，导致肛门狭窄等情况出现，在保守治疗效果不好的情况下，就需要手术治疗。对于脓肿，应该手术切开引流，将脓液清除，从而治愈病变；而对于肛门狭窄患者，可以进行粘连松解，改善肛门狭窄的情况。
