阻塞性睡眠呼吸暂停综合征的不良后果，包括引起患者缺氧导致患者的全身各个系统都会因为缺氧出现一系列的病变，比如有可能会引起脑缺氧，导致头痛头晕脑胀，记忆力下降，心脏缺氧有可能会导致心肌缺血、心肌劳累、冠心病甚至诱发心肌梗死。肾脏缺氧有可能会导致肾功能下降，消化系统缺氧可以引起腹胀厌食、消化不良。还有可能会诱发糖尿病、甲状腺功能减退。严重的有可能会引起精神状况改变甚至导致猝死。
阻塞性睡眠呼吸暂停综合征主要是导致机体缺氧，所以全身各个系统都会受到影响。一旦出现对身体的影响要及时的进行治疗改善患者低通气状态，纠正缺氧的症状。
