根治溃疡性结肠炎只能通过手术的方法治疗，通过手术把发病的肠段切除，这样才能达到彻底根治。
因为溃疡性结肠炎和自身免疫因素有关，所以一般的治疗是不可能完全根治的，只能通过相应的药物治疗，控制住临床症状可以治愈疾病，但是不可能达到根治，因为有自身免疫因素的原因，以后还有可能会导致免疫损伤而出现新的溃疡性结肠炎的。
临床上很多疾病都是没有办法完全根治的，只能做到临床治愈。只有手术把相关的肠道切除了才有可能根治，但是这样也会带来新的副作用，有可能会影响正常的肠道功能。
