对于雌激素受体阳性的人，乳腺癌HER-2阴性比阳性好。对于雌激素受体阴性的人，乳腺癌HER-2阳性比阴性好。
HER-2是乳腺癌中非常重要的分子标志物，HER-2表达阳性是预后不良的指标，其恶性度高，复发和转移的概率也比较高。因此对于大部分乳腺癌类型来说，HER-2阴性更好。
但是，临床上可以使用HER-2靶向治疗改善预后，因此相比“三阴性”乳腺癌这种缺乏治疗手段的类型来说，HER-2阳性更好。
乳腺癌具体的预后和治疗方案的制定和肿瘤的病理分期，分子分型等因素有很大的关系，需要综合判断和分析。临床上如果HER-2阳性、基因检测有出现扩增，在其他治疗的同时需要配合靶向治疗。
