胃肠间质瘤是否需要活检需根据病情来决定。
大多数情况通过胃镜、超声胃镜或者是CT就可以认出是否胃肠间质瘤，通常不需要活检。一般情况下不主张术前活检，活检可能造成肿瘤的出血或破溃，从而提高肿瘤播散的危险。
在有些情况下需要活检的话可以考虑内镜引导下细针抽吸活检，安全可行，如复发转移性间质瘤，在首诊时没有取得病理诊断，要进行穿刺活检。
还有就是特殊的胃肠间质瘤，瘤过大或者瘤在特殊部位，考虑患者需要直接做手术时，且手术风险太大，需要切除其他重要的器官，且有可能威胁到患者的生命安全时可进行细针抽吸活检。
