多发性肝内胆管结石相对来说是比较严重的胆道系统疾病。
多发性肝内胆管结石分布的部位越多，累及的胆管节段越多，术后的并发症也会增多，很难彻底根治。特别是肝内胆管结石位于胆管远端时，手术操作相对比较困难，没有办法将结石全部取出，需要通过切除部分胆管所在的肝叶达到治疗目的。
手术创伤比较大，而且手术后的并发症发生几率也会相对增加。部分患者术后还会复发肝内胆管结石，严重的患者需要进行肝脏移植手术，才可以达到控制病情的目的。
所以，多发性肝内胆管结石治疗起来比较困难，需要尽早进行治疗。
