儿童矮小症需要检查的项目有血液生化检测、骨龄测定、甲状腺功能检查、生长激素水平检测、胰岛素生长因子检测、脑部核磁共振（观察脑垂体结构）等。
- 骨龄检测：即医生会给孩子拍左手掌骨、指骨、腕骨的正位片。此项目常用来评价孩子的生长发育和成熟状态。
- 怀疑为甲状腺功能减退引起的身材矮小患儿，需进行甲状腺功能的相关检查，以协助诊断。
- 怀疑为生长激素缺乏导致的身材矮小患儿，需对机体生长激素的情况进行评价，还要了解胰岛素生长因子、垂体的结构以及其它协同激素的情况。
- 需要警惕下丘脑占位疾病导致的，需要进行下丘脑核磁共振等检查明确。
