鼻窦炎的临床症状包括鼻部症状和全身症状：
流黄脓性鼻涕、鼻塞、头痛是鼻窦炎常见的鼻部症状。炎症对于鼻窦黏膜的刺激会导致黏膜分泌物增多形成鼻涕，当过多的脓性分泌物随鼻涕排出体外时，会引发流黄脓性鼻涕症状。炎症的刺激会导致鼻黏膜充血肿胀，进一步会导致鼻部通气量下降引发鼻塞症状。鼻塞期间会导致脑组织细胞供氧不足引发头痛症状。
急性鼻窦炎发病期间炎症的刺激会引起发烧，发烧期间患者会出现畏寒怕冷、四肢关节酸痛、乏力、食欲不振等全身症状。慢性鼻窦炎会导致脑细胞长期处于一种缺氧状态，从而可能会引发精神萎靡、记忆力减退、嗜睡等神经系统症状。
