甲状腺癌总体来讲，最好的治疗方法仍是手术切除。
对于小于1cm的甲状腺乳头状癌，若刚发现，可以选择暂时观察，看肿瘤的生长变化，若观察期间无生长，则可继续观察随访。
对于大于1cm的甲状腺乳头状癌，手术治疗是唯一有效的治疗措施，根据具体情况，选择一侧腺叶切除或全甲状腺切除，并根据是否存在淋巴结转移，而做颈淋巴结清扫。甲状腺滤泡癌和髓样癌，均应手术治疗。
而对于预后极差的甲状腺未分化癌，手术有一定的争议，但建议对于可切除的甲状腺未分化癌，手术切除病灶可在一定程度上延长患者的生存期。
当然，国内部分学者对甲状腺癌进行消融治疗，但此治疗方式总体的预后和复发率没有可靠有效的询证学依据，相应的指南也没有明确的建议消融治疗甲状腺癌，故对消融治疗甲状腺癌应持比较谨慎的态度。
