窦性心律不齐的原因分为生理性原因和病理性的原因。
引起窦性心律不齐的生理性原因多见于吸烟、喝酒、喝浓茶、喝咖啡、情绪过于激动、过度劳累、夜间睡眠状态、运动员、长期进行重体力劳动等人群。
引起窦性心律不齐的病理性原因也可以是一些器质性的心脏病，比如：先天性心脏病、急性冠状动脉缺血、窦房结病变、心包炎、病窦综合征等疾病。另外，有些患者存在甲状腺疾病、肿瘤、风湿热等也有可能会引起窦性心律不齐。
引起窦性心律不齐的原因比较多，需要进行相关项目检查后明确病因。
