急性化脓性甲状腺炎是有可能会复发的。
一般情况下，导致急性化脓性甲状腺炎多是由于细菌感染所导致，而普通细菌所导致的急性化脓性甲状腺炎，通过细菌培养及药敏试验，选择敏感抗生素抗感染治疗疾病痊愈后，一般复发的可能性极小。
但是对于一些特殊细菌如结核杆菌感染，后期继发普通感染所导致的急性化脓性甲状腺炎患者，后期即使普通细菌治愈后，但由于仍存在有抗酸杆菌，会导致机体免疫功能下降，而存在有再次复发的可能性。
所以这种情况下就需要长期、规范、足量、全程应用抗结核药物治疗，在根治抗酸杆菌同时，增强自身抵抗力，以避免疾病的再次复发。
