颈肩痛一般由颈椎疾病引起，主要是由神经根型颈椎病引起。
颈椎病是由椎动脉、脊髓或交感神经受压引起的一系列症状。
颈肩痛疼痛的原因往往来自颈椎，因为支配肩部的神经都起源于颈椎，神经根在颈椎，因为椎间盘突出或骨质增生压迫神经，或肿瘤压迫神经根就会引起疼痛，这也是颈肩痛的常见原因。随着病情的发展，炎症反应可从颈部后方的肌肉扩散到背部的斜方肌和背阔肌，甚至一些软组织和筋膜，引起剧烈疼痛。
此外，引起颈肩痛的原因包括伏案工作、看电脑、手机等工作方式或生活习惯，引起颈部肌肉劳损和炎症，进而引起颈肩疼痛。
