慢性萎缩性胃炎的病因有可能和自身免疫因素导致胃黏膜损伤有关，有时候也有可能和炎症以及其他外界因素的刺激等有关。
这种疾病的病因并不十分明确，检查发现胃体萎缩性胃炎的患者体内相关抗体增高，所以有可能是自身免疫因素紊乱导致的。如果平时有喝酒、幽门螺杆菌感染以及其他有害物质的刺激，有可能会加重病情诱发疾病等。
因为具体原因并不十分明确，所以也没有特别有效的办法治疗发生萎缩性胃炎，主要是养胃护胃、对症处理，减轻胃病的症状。有胃黏膜损伤的可以使用保护胃黏膜的药物治疗，有幽门螺杆菌感染的，可以根除幽门螺杆菌。
