由于免疫功能的异常和遗传因素的参与作用，使得小儿得系统性红斑狼疮。
系统性红斑狼疮的发生主要是由于机体的免疫功能出现紊乱，导致自身抗体的增加，引起免疫复合物的增多导致炎症反应的发生，由于小儿的免疫系统尚未发育完善，容易出现免疫功能障碍，可能发生系统性红斑狼疮。
另一方面，系统性红斑狼疮患者的后代，由于可能携带某些致病基因，发生系统性红斑狼疮的概率比正常人更高，提示遗传因素参与狼疮的发病。因此，小儿发生系统性红斑狼疮与免疫功能和遗传因素作用有关。
