脊髓空洞症的手术时间有非常大的差异，因为首先脊髓空洞症有不同的手术方式，这样手术时间就会有不同，并且针对于同一种手术方式，会根据手术者的熟练程度以及手术过程中的精细程度而手术的时长有差别。
对于因为颅颈交界处的发育畸形导致的脊髓空洞症，可以做后颅窝减压、小脑扁桃体下疝畸形切除、寰枕筋膜扩大成形手术，大致手术时间2-4小时，对于一些合并寰枢椎脱位的患者还需要内固定，手术时间会更长一些。对于单纯性的脊髓空洞症可以做脊髓空洞分流手术和造瘘手术，手术时间大约要1-3小时左右。除手术操作外，麻醉准备、体位摆放、术区消毒、麻醉清醒等时间也需要1-2小时。
