在临床上诊断胰腺癌常用的方法包括增强CT或增强磁共振等影像学检查，血清CA199也是重要的参考标准。但以上检查结果仅供参考，虽然准确率较高，但也存在一定误差，有误诊的可能。胰腺癌的最终确诊标准是病理学检查，通过细胞学和组织学诊断。
如果发现胰腺有占位性病变并高度怀疑为胰腺癌，手术可切除者应尽量争取手术机会，手术后通过病理学检查可以确诊。也有些患者虽然高度怀疑为胰腺癌，但由于肿瘤范围较大或侵犯重要血管，而无法手术切除，这种情况下可以考虑内镜超声下胰腺穿刺活检，取到少量胰腺组织后，再进行病理学检查。当然，这种穿刺方式，由于取到的组织量较少，也经常会遇到假阴性的情况。
