甲亢并发症是由于甲亢长期未得到控制，影响到全身其他脏器，导致出现脏器功能损伤。
最常见的有甲亢性心脏病，患者会有心律失常（房颤、房扑、室性早搏等）、心脏增大、心脏功能减退，严重的患者发生心脏衰竭。
甲亢会影响肝功能，造成肝功能（ALT、AST、GGT、ALP等）、胆红素升高，出现食欲下降、恶心、皮肤、巩膜发黄等。
甲亢导致神经肌肉系统受损，出现低钾性周期性麻痹，常见于青年男性，表现为患者早晨醒后，四肢软瘫症状，严重的会影响到呼吸肌，危及生命。
另外，甲亢患者的血液系统也会出现改变，造成白细胞减少、贫血等。
