对于大多数的甲状腺结节，无论是良性还是恶性的，很少有疼痛症状或压痛。除非以下2种情况下，甲状腺结节会发生疼痛。
第一是甲状腺腺瘤发展到一定程度，特别是甲状腺滤泡性腺瘤，由于腺囊内血管破裂出现囊内出血，结节可在短期内迅速增大，出现疼痛，但较少发生。第二考虑可能是合并其它甲状腺疾病，比如亚急性的甲状腺炎常会引起疼痛，常继发于病毒性上呼吸道感染，还会引起甲状腺肿胀、发硬、吞咽困难等。如出现上述症状，可行甲状腺结节穿刺病理学检查，明确性质，判断是否有手术指征。
