狼疮性肾炎患者通过正规治疗可以临床得到缓解，但往往需要长时间用药维持，长期停药多会复发。
狼疮性肾炎是对系统性红斑狼疮预后影响最大的并发症，其中肾衰竭是系统性红斑狼疮主要死亡原因之一，尤其是出现严重的急进性狼疮性肾炎的患者，由于多脏器功能的严重损害，合并全身性感染，其病死率较高。
另一方面，长期的慢性肾功能不全，以及药物的应用，特别是长期使用大剂量的激素，可引起全身的不良反应，这些都是系统性红斑狼疮患者死亡的部分原因。狼疮肾炎患者的预后与其病理类型有关，以I和II型的预后较好，生存期长；而VI型的预后最差，死亡率高。
