肾结石手术主要可以分为两种，第一为体外冲击波碎石治疗，适用于结石体积较小且无明显并发症的患者。第二为微创手术，又可分为经皮肾镜碎石取石术、输尿管硬镜以及输尿管软镜碎石术，此方法虽然创伤大于体外冲击波碎石，但是相较而言，疗效更确切，清石率更高，还可以同时解决结石合并输尿管狭窄等解剖异常的问题，是临床常用的手术治疗手段。
最后若进行上述治疗手段均失败的患者必要时仍可考虑行开放性手术治疗，比如肾盂切开取石术，不管何种治疗方式，术前均需充分告知患者有结石残留的可能，术后患者还需要根据结石成分分析结果，调整生活方式，尽量减少结石的复发。
