肾盂肾炎常见的感染途径有上行感染、血行感染、直接感染以及淋巴道感染。病原菌经由尿道上行至膀胱，再到输尿管、肾盂、肾盏引起的感染称为上行感染，在临床上多见；大肠埃希菌是最常见的肾盂肾炎致病菌。血行感染是指病原菌通过血液循环到肾脏引起肾盂肾炎，此途径较少见，常见的病原菌有金黄色葡萄球菌、沙门菌属、假单胞菌属和白念菌属。直接感染常见于泌尿系统周围器官组织发生的感染，病原体直接进入泌尿系统而发生感染；淋巴道感染是当盆腔和下腹部的器官发生感染，病原菌可从淋巴道感染引起肾盂肾炎。
