小儿腹痛的原因很多，可以是腹内疾病引起，也可以是腹外疾病所致。可以是消化系统，也可以是其他系统疾病所致。
第一、常见的腹内疾病：包括肠痉挛性绞痛、肠系膜淋巴结炎、急性胃炎、胃肠炎、肝炎、急性胰腺炎、腹膜炎、尿路感染等。儿外科常见：急性阑尾炎、肠套叠、嵌顿性腹股沟疝、泌尿道结石、急性肠扭转、睾丸蒂扭转等。
第二、常见的腹外疾病：呼吸道感染、急性心力衰竭、心包炎、心肌炎、过敏性紫癜、荨麻疹、哮喘、低血糖、尿毒症、伤寒、流行性脑脊髓膜炎、带状疱疹、败血症、铅中毒等。
第三、非特异性腹痛：是一种常见的儿童身心疾病，发生率在5-10%，临床和实验室检查常常没有阳性发现，可能与情绪、家庭成员焦虑有关。
