原发性小血管炎肾损害可以导致肾功能衰竭。大部分原发性小血管炎肾损害的患者，表现为急进性肾功能衰竭，其临床特点是肾功能损害进展迅速，早期就可能出现急性肾功能衰竭的表现，如少尿、水肿，需要进行血液透析，早期进行强化治疗，预后相对较好，部分患者可能会缓解，但只有少数患者肾功能可以恢复正常。对于肾功能无法恢复的患者，一部分可能最终转化成慢性肾功能衰竭，需要进行肾脏替代治疗，如血液透析、腹膜透析或肾移植，从而改善病人的生存预后。
