肠道穿孔的原因有外伤性穿孔、肠道疾病导致的穿孔和医源性穿孔。外伤性肠道穿孔分为闭合性和开放性。闭合性肠道穿孔腹部没有伤口，一般是腹部受到撞击如车祸，建筑物倒塌等导致的；开放性肠道穿孔多见于刀刺伤和枪伤。还有一些肠道疾病治疗不当，控制不佳，疾病发展可以引起肠道穿孔，比如常见的十二指肠溃疡穿孔，肠伤寒穿孔，溃疡性结肠炎穿孔，克隆恩氏病穿孔，肠梗阻晚期肠穿孔等。医源性穿孔主要是在做胃肠镜、结肠镜时发生。
