甲状腺炎有急性化脓性甲状腺炎、亚急性甲状腺炎和慢性甲状腺炎三种，疾病不同就诊的科室不同，相同疾病不同的阶段就诊的科室也不同。急性化脓性甲状腺炎成年人可以就诊于感染科、儿童就诊于儿科，也可以就诊于耳鼻喉科。如果脓肿形成需要手术切开引流一般去普外科或者是耳鼻喉科就诊。亚急性甲状腺炎和慢性甲状腺炎一般去内分泌科就诊。如果经过内分泌科正规治疗，甲状腺没有缩小，或有压迫呼吸道症状，或者是有甲状腺结节怀疑恶变等情况，一般去普外科或者是耳鼻喉科就诊，接受手术治疗。
