肩胛骨缝疼痛的主要病因包括有:一、着凉、过度劳累、重体力活动过度牵拉筋膜导致筋膜炎会引起肩胛骨缝疼痛。二、长期使用不良姿势或重复一个姿势,导致筋膜充血水肿和渗出,会引起肩胛骨缝疼痛。三、外伤如肩胛骨骨折、肋骨骨折等会导致肩胛骨缝疼痛。四、类风湿性关节炎会导致肩胛骨缝疼痛。五、冠心病等心脏疾病,疼痛会向背部放射从而导致肩胛骨缝疼痛。六、肺部疾病、胸腔积液等胸腔脏器疾病会导致肩胛骨缝疼痛。