确诊直肠癌一般是通过直肠指诊、肠镜检查，而实验室化验、CT和核磁共振是辅助检查。
大约80%的直肠癌患者可以被直肠指诊发现。检查者在指诊中在可发现质地硬、表面凹凸不平直肠肿块。直肠癌晚期可以发现直肠肠腔狭窄，肿块固定。指套见含粪的污浊脓血黏液。
直肠镜检查可以在直视下观察直肠肿块的形状、生长部位、肿块的上下缘以及肿块距肛门的距离。并且可以取一部分肿块组织做病理切片检查，病理检查可以明确肿块性质及其分化程度，也就是确诊直肠癌。
而实验室化验、CT和核磁共振检查可以对直肠癌的诊断有一定的帮助，但不能确诊。
