胆石症常见的危害可分为结石直接引起的病变与结石引起的并发症。
结石直接引起的危害有胆绞痛，表现为进食油腻食物或夜间出现右上腹部或上腹部的胀痛，持续超过20-30分钟；部分病人疼痛可自行缓解，或口服药物后缓解。如疼痛持续24小时不缓解，则转变为急性胆囊炎，可有肝功能异常。若出现胆囊增大、壁厚，胆囊周围积液、穿孔，胆囊内瘘等并发症，则需要手术治疗。
结石引起的间接危害或其并发症主要有急性胆管梗阻、胆管炎，急性胰腺炎、Mirizzi综合征、胆囊十二指肠瘘、胆囊结肠瘘或结石性肠梗阻。
部分病史较长的患者，可诱发胆囊癌；肝内多发结石病人可能发生胆管癌、肝脏纤维化严重时可发生肝功能衰竭。
