强直性脊柱炎的病因尚不明确，目前认为与携带HLA-B27基因有关。
强直性脊柱炎至今病因未明，相关研究认为可能与遗传性易感因素有关，其中HLA-B27与本病关系密切。相关流行病学调查发现强直性脊柱炎好发于16至30岁的青壮年，其中男性占90%，大多有明显的家族遗传史。强直性脊柱炎患者中，HLA-B27的阳性率可高达88%至96%，但并非所有具有B27抗原的患者都会发生强直性脊柱炎，B27基因还可以影响疾病严重程度。
强直性脊柱炎主要是通过破坏软骨、腐蚀与软骨下骨皮质硬化，最后引起关节的纤维性或骨性强直和畸形，从而影响患者活动。
