先天性胆总管囊肿的治疗，主要是手术治疗，具体的手术方式要根据病变的范围和囊肿的部位来决定。如果囊肿位于胆总管，可以切除胆总管囊肿，肝门部胆管和小肠做吻合手术。如果囊肿位于肝内胆管，手术切除比较困难。先天性胆总管囊肿的手术方式，主要是开腹手术和腹腔镜手术，腹腔镜手术属于微创手术，这种手术创伤小，恢复起来比较快。但是如果胆管炎比较严重，这种情况病变的范围比较广，或者怀疑有癌变，可以开腹手术。先天性胆总管囊肿可以发生感染、结石、出血，少数病人甚至发生癌变，所以诊断明确后应该积极手术切除治疗。
