肝内钙化灶是肝细胞受到损失以后细胞坏死，纤维组织增生，然后逐渐形成瘢痕，钙盐在炎症部位沉积造成的一种病理变化。原因很多：可能和先天性因素有关，也可能和某些病变有关，如肝脏外伤、结核、脓肿、肿瘤等。但是大多是单纯的钙化，具体原因不清楚，病人也没有上述的相关病变。肝内钙化灶，因此发现钙化灶以后应该通过一定的检查来明确其性质，如果是单纯的钙化灶，一般不需要治疗，无需过度紧张；若是在结核、肝肿瘤等疾病基础上形成的钙化灶，则需要治疗其原发病。
