肝管里有结石需要根据病情严重程度，采取相应的治疗。
肝管结石一般指肝内胆管结石。肝内胆管结石在我国比较常见，结石堵塞胆管，继发胆道感染、胆管反复炎症及修复，造成胆管瘢痕增生、局限性狭窄，其近侧压力升高、胆管扩张、结石堆积、胆汁淤滞，久之，相应区肝组织纤维化、萎缩，因此容易并发胆管梗阻及胆管炎，大部分需要考虑外科处理。
若肝内胆管结石造成胆道反复发生感染，已经引起肝组织萎缩甚至功能丧失，可以切除丧失功能的部分肝组织，此手术方法可以在一定程度上防止病变的肝脏发生癌变。对于主干的胆管结石可以通过ERCP取石或者切开胆管取石。本病可引起严重并发症，是良性胆道疾病死亡的重要原因。
