并不是所有的结肠间质瘤都能进行手术治疗。是否能进行手术治疗，主要取决于间质瘤的病变性质、病情的进展程度等。根据结肠间质瘤的病变性质，主要可以分为良性结肠间质瘤和恶性结肠间质瘤两类。
其中，良性结肠间质瘤的预后较好，患者的生存期较长，通常仅通过手术治疗就可达到较好的效果。
但对于恶性结肠间质瘤，尤其是对于已经发生转移或浸润的患者，手术治疗的效果往往不佳。需要通过综合性的治疗或者姑息疗法等，来尽可能地改善症状，延长生存时间，改善生存质量。
