甲胎蛋白高不一定就是肝癌，因为肝硬化、慢性肝炎等疾病的病人也可能导致指标异常。
甲胎蛋白检查是诊断肝癌的方法之一，但并不是肝癌诊断的金标准，单纯的甲胎蛋白升高不能确定就是患有肝癌。因为妊娠的活动性肝炎、转移性肿瘤、生殖腺的胚胎瘤或肝硬化活动期的病人，甲胎蛋白也会升高。有一些患有慢性肝炎的病人，也可能检查出甲胎蛋白异常。
如果只是一次检查结果升高，还需要动态的观察，如果明显的升高并且持续4周以上就有肝癌的可能性，应该进一步的检查，确定诊断再治疗。
