根据甲状腺炎类型不同，疾病发展阶段不同，采取不同的治疗方法。
常见甲状腺炎可分为两大类，分别是桥本甲状腺炎和亚急性甲状腺炎。
桥本甲状腺炎早期可以出现TPOAb和TGAb抗体滴度的增高，导致一过性的甲亢，此时采取小剂量抗甲亢治疗。晚期患者出现甲状腺功能减退症，可以采取甲状腺激素类药物替代治疗。
出现气道压迫、声音嘶哑等症状以及疑似合并有甲状腺癌的患者应接受手术治疗。
亚急性甲状腺炎患者首选非甾体抗炎药和糖皮质激素，能够明显缓解甲状腺疼痛。
针对甲状腺毒症表现，可给予β受体阻滞剂对症治疗。
针对一过性甲减的情况，可给予小剂量甲状腺激素类药物替代治疗。
