巨结肠手术后部分患者可能会复发，但具体的复发时间是不定的，复发受多种因素影响，如：手术中有一段肠道缺血，出现神经病变，导致术后复发。有些患者因自身体质原因，术后复发。
一般来说，先天性巨结肠手术后九年复发概率较低。若患者恢复较好，复发可能性小。恢复情况较差，容易复发。
患者被确诊为先天性巨结肠时，应立即就医，尽早治疗。先天性巨结肠患者除了手术治疗外，日常生活中要注意作息规律，多喝水，多吃蔬菜、富含维生素水果，注意避免辛辣、刺激的食物，多进行锻炼，定期去医院复查。
