直肠癌的吻合口瘘一般都可以治愈，个别患者可能成为永久性瘘口。
症状比较轻微、没有形成明显腹膜炎的吻合口瘘，可以进行保守治疗，包括放置引流管、进行瘘口冲洗、使用抗生素预防和治疗感染、静脉输液给予营养支持治疗等，大部分患者都可以治愈。
当吻合口瘘比较大或者引起了明显的腹膜炎，以及全身中毒症状比较严重，通常都需要进行手术治疗，基本上也可以治愈。
个别患者的体质比较差、癌性消耗比较严重、营养不良明显，形成的吻合口瘘有可能经久不愈，主要见于直肠癌晚期或者合并其他严重慢性疾病的患者。
