肝外胆管损伤的危害主要会伴有静脉、血管以及邻近器官的损害，可以引起胆汁性腹膜炎，继发感染等。
由于肝外胆管位置比较深，临床上单纯的肝外胆管损伤比较少见，多数伴有门静脉、下腔静脉、肝脏、脾脏以及十二指肠等脏器的损伤。
可以引起大出血、消化道穿孔，以及引起胆瘘，由于胆汁是化学性物质，所以可以引起腹膜炎，容易引起细菌感染，继而引发感染性休克而危及生命。
出现肝外胆管损伤后需要及时明确诊断，可以行彩超、CT、胆道造影等检查，明确后需要及时手术，不能延误。
