肾积水手术具有一定的危险性，且手术方式不同，其手术风险大小也不一样。
如果是因为泌尿系统结石引起的肾积水，通常需要根据结石的部位、大小，采取相应的治疗措施。
若选择经皮肾镜手术，其手术风险相对比较大，有可能会出现术中出血及感染。
如果采取输尿管切开取石术或者是输尿管镜下的激光碎石手术，相对于风险比较小，但风险依然存在。
通常出现肾积水，及早进行临床干预，一般不会影响自然寿命。如果并发肾功能衰竭，患者的生存寿命时间会有不同程度的缩短。
